確保色譜柱不進入顆粒物，樣品一定要經過預處理，去除顆粒物等會給泵和色譜柱帶來負擔的物質。接
離子色譜柱前確保系統已清洗干凈，色譜柱在任何情況下不能碰撞、彎曲或強烈震動。很多單位的離子色譜儀是陰、陽離子混用的，因此，接色譜柱前，一定要保證整個離子色譜儀上的所有閥件或管路已清洗干凈，避免造成色譜柱堵塞。
確保離子色譜柱不干燥。每天分析工作結束后，要清洗進樣閥中殘留的樣品，還要用適當的溶劑來清洗柱；若分析柱長期不使用，要參照色譜柱保存辦法，在沖洗干凈后，對陰離子柱要通入一定濃度的堿（對陽離子柱要通入一定濃度的酸），并將色譜柱取下兩端密封保存。
確保離子色譜柱在一定壓力、流速條件下運行。儀器使用時一定要先檢查整個流動管路中是否有氣泡，如果有，需要先將氣泡排除后再將色譜柱接上，防止將氣泡帶到色譜柱中。因為色譜柱中裝填的樹脂顆粒很小，氣泡進入后將影響樹脂和樣品中離子的交換，同時氣泡也將影響基線的穩定性。大概流程： 高壓輸液泵將流動相以穩定的流速（或壓力）輸送至分析體系，在 色譜柱之前通過 進樣器將樣品導入，流動相將樣品帶入色譜柱，在色譜柱中各組分被分離，并依次隨流動相流至 檢測器。
離子色譜柱是一款高容量氫氧根體系色譜柱，用于分析疏水性離子（包括多磷酸鹽，硫氰酸鹽, 硫代硫酸鹽, 高氯酸鹽） 和多價陰離子（包括多磷酸鹽和聚羧酸鋅）。AS16柱適合分析飲用水中高氯酸鹽，該柱符合U.S. EPA 314.1標準離子色譜柱是離子色譜儀的核心部件之一，樣品中各種離子的分離均在色譜柱中完成，并且一般比常規液相色譜柱價格要貴很多。因此，對離子色譜柱的維護保養十分重要。
